Conseils pour la rédaction de votre premier article de revue de littérature scientifique – kit pour ecrire un livre

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Emily Crawford se retirait souvent sur le toit de son appartement à San Francisco pour rédiger son avis. Photo gracieuseté de Matthew Perry.

Lorsque j’ai entrepris la tâche de rédiger un article de revue de littérature scientifique l’année dernière, j’avais espéré qu’une recherche sur Google révélerait une poignée de pages de procédures conçues avec soin par des vétérans de ce processus d’écriture. Je n'ai rien trouvé de tel, alors je me suis débrouillé toute seule, inventant des techniques pour moi-même. Je propose maintenant cette pièce à d’autres jeunes scientifiques qui se retrouvent dans des situations similaires. Ce que vous lisez maintenant est essentiellement une histoire de cas avec un N d’un, mais c’est le type d’essai que j’aurais aimé avoir à ma disposition quand j’ai commencé.

Je courais une protéine sur une colonne de nickel un dimanche soir de février 2010 lorsque mon conseiller m'a contacté pour une co-création un article de revue pour la Revue annuelle de biochimie. Mon conseiller est un gars occupé, avec beaucoup de papiers et de subventions, donc je savais que par «co-auteur», il voulait dire que je serais le principal chercheur et écrivain, et que je recevrais pour la plupart de larges suggestions. Cela me convenait. En tant qu’étudiante de cinquième année, j’avais appris à faire face à l’extrême indépendance, et même à la préférer. Pour être honnête, j'étais ravi d'avoir l'occasion d'examiner la littérature de manière approfondie et d'en tirer quelque chose d'utile. La date d’échéance étant le mois d’août, j’avais donc six mois pour synthétiser des documents de recherche sur notre sujet, valant des décennies, en un ensemble de faits et d’interprétations joliment emballés, joliment emballés.

Commencer

Notre sujet était les substrats des caspases, un groupe diversifié de protéines essentielles à la mort cellulaire programmée et donc importantes pour comprendre comment tuer les cellules cancéreuses. Une recherche sur PubMed sur les «substrats de caspases» a donné plus de 2 000 articles de recherche. Je ne me doutais pas que ce projet pouvait avoir une approche globale, et heureusement, mon conseiller ne l’a pas fait non plus. Il me faudrait évaluer les limites imposées par le journal (30 pages, six mois), ainsi que mes propres limites et la nécessité d'équilibrer le projet d'écriture avec le travail de laboratoire qui était essentiel pour terminer mon doctorat.

Réduire la portée de l'article pour se conformer à ces limites était peut-être le plus gros défi de ce processus.

Sachant que je travaillais mieux lorsque je me concentrais sur un projet à la fois, j'ai passé les deux mois suivants à effectuer tous les travaux de laboratoire habituels sans réfléchir à l'article de synthèse et à parcourir la littérature lorsque j'avais le temps. Après cela, je suis passé à la lecture et à l’écriture à plein temps. J'ai trouvé un café que j'aimais dans mon quartier et y ai passé presque tous les matins cet été à boire du thé, à manger des muffins à la citrouille et à travailler sur mon ordinateur portable. Les après-midi, je passais souvent à écrire dans mon appartement ou à la bibliothèque du campus. Je savais qu'il serait impossible de se concentrer sur l'article dans mon laboratoire encombré et bruyant, mais il était également essentiel de passer du temps là-bas chaque semaine pour consulter mes collègues de laboratoire sur mes recherches documentaires, pour me tenir au courant des travaux de laboratoire et des commérages, ainsi que pour retrouver mon ergonomie. des pipettes provenant des bancs d’autres personnes autour du laboratoire (elles semblaient toujours se faire kidnapper dès que je publiais une mise à jour du statut «à domicile» sur Facebook).

Le produit fini

Il m'est arrivé de me sentir dépassé par la tâche et de ne pas voir la voie à suivre pour terminer l'article à temps. J'essayais de me rassurer en me rappelant que j'avais plutôt bien écrit des termes à l'université; mais c’était une tâche plus vaste et susceptible d’avoir un impact sur quelqu'un, quelque part, qui voulait parfois se renseigner sur les substrats de caspases. Finalement, j'ai terminé à la date limite (enfin, plus une extension de deux semaines que l'éditeur a accepté de m'accorder) et je suis très satisfait du produit et de tout ce que j'avais appris sur les substrats de caspases, sur la littérature scientifique et sur la revue. -processus d'écriture. Pourtant, j’estime que lors de ma prochaine tâche, je pourrai le faire en deux fois moins de temps. J'espère que les conseils suivants aideront d'autres scientifiques qui se trouvent dans ce genre de territoire inconnu.

Je terminerai en mentionnant que, pour moi, c’est l’une des expériences les plus enrichissantes que j’ai vécues au cours de mon doctorat. étudiant. La synthèse de toutes sortes de données provenant d'expériences réalisées par des scientifiques du monde entier en une histoire cohérente s'est avérée très satisfaisante. J'ai hâte de le refaire un jour, peut-être d'une manière un peu plus efficace.

  1. 1. Définir la portée de l'article. Faites un plan, gardez des listes de sujets qui sont et ne sont pas dans votre champ de vision, et rappelez-vous d'arrêter chaque fois que votre lecture s'éloigne de votre champ de vision. Mon conseiller et moi-même avons décidé de consacrer la première moitié de notre article à une vaste étude de quelques sujets de recherche clés (par exemple, les détails physiques de l'interaction caspase-substrat) et de consacrer la seconde partie à quelques vignettes très détaillées sur certaines des centaines de substrats de caspases connus.
  2. 2. Vos collègues et collaborateurs sont des ressources inestimables. Chacun a un domaine d’expertise spécifique qui est probablement légèrement différent du vôtre. Demandez à vos collègues quels papiers ils donneraient à un étudiant alternant à lire et quelles sont les avancées les plus importantes récemment sur le terrain. (Veillez à ne pas vous laisser trop égarer. Les idées de vos collègues vous aideront peut-être à définir votre portée lorsque vous débuterez, mais vous n’aurez pas à incorporer toutes leurs suggestions si vous ne les jugez pas pertinentes. .)
  3. 3. Ne vous attardez pas sur les articles précédents qui ont été écrits sur votre sujet (cela peut rapidement devenir un trou noir qui prend du temps et vous donne une insécurité inutile quant à la contribution que vous essayez d’apporter au terrain), mais familiarisez-vous avec leur contenu. Recherchez les domaines qui n'ont pas encore été examinés de manière approfondie ou ceux pour lesquels vous pensez avoir revu de vieilles données. Une des choses les plus pénibles qui puisse arriver est de passer des jours à lire et à écrire sur un sujet pour ne pas oublier plus tard qu’il existe une section d’un autre article de synthèse qui explore le même domaine, fait référence au même ensemble d’articles et aboutit aux mêmes conclusions.
  4. 4. Mettez-vous à l'aise. Cela peut sembler évident, mais je pense que c’est important. Trouvez des endroits où vous pouvez vous concentrer et prenez souvent des pauses pour vous étirer, prendre une collation ou même sortir quelques minutes. Les jours où je me débattais avec la concentration, j'avais souvent recours à une minuterie pour structurer ma journée. Je travaillais pendant 60 minutes, puis je prenais une pause santé mentale, puis je travaillais encore 60 minutes, et ainsi de suite.
  5. 5. Imposer une structure au désordre qu'est la littérature scientifique. J'ai élaboré une stratégie pour chaque sujet de recherche que je souhaitais examiner (y compris la section générale de l'enquête au premier semestre et les sections de la vignette au second semestre). Tout d’abord, j’ai trouvé les articles les plus récents sur le sujet et les ai lus, en choisissant ce qui semblait être des références importantes. Je suis retourné à une dizaine de documents clés. Ensuite, j'ai rapidement lu et rédigé un résumé pour chacun, généralement sous la forme d'une liste à puces des conclusions tirées de chaque figure. Ensuite, j'ai combiné ces résumés en un seul tableau. (Je l'ai fait à la main sur papier; une feuille de calcul Excel pourrait également fonctionner). Chaque article de recherche était composé d’une rangée (classés par date de publication) et les colonnes étaient les résultats obtenus ou les conclusions tirées. Je pouvais alors facilement voir quels papiers convenaient sur quels sujets, quelles tendances se dégageaient au fil du temps et quelle était la place des controverses sur le terrain. J'ai découvert qu'une fois que j'ai créé un tableau, le récit de ce sujet de recherche en particulier a presque été écrit.
  6. 6. Passez du temps à écrire avec tous vos PDF et navigateurs Web fermés et votre bureau débarrassé de tout papier. C'est ce conseil que mon conseiller m'a conseillé environ un mois avant la date d'échéance, lorsqu'il a pu constater que mon cerveau et ma bibliothèque de PDF étaient si débordants de données que j'avais du mal à produire du texte. Je n’ai pas trouvé cela facile au début. Je ne voulais rien obtenir de mal, même dans un brouillon, alors j’avais peur de taper une seule phrase sans références pour me soutenir. D'autre part, avec Internet et tous mes fichiers PDF devant moi, j'avais tendance à générer des phrases très denses en informations mais pas nécessairement liées les unes aux autres – et pas toujours pertinentes pour les récits scientifiques spécifiques que j'essayais de décrire. composer. L’écriture n’a vraiment progressé que quelques jours après-midi d’août, assis sur le toit-terrasse de mon immeuble, avec un crayon et du papier et aucun appareil compatible Internet. Oui, j'ai parfois écrit des choses incorrectes (ou du moins imparfaites) lors de la construction d'une section à partir de la mémoire. Cependant, je me suis souvent retrouvé avec un puissant échafaudage sur lequel je pourrais ajouter plus tard certaines de ces phrases denses et chargées de faits.
  7. 7. N’hésitez pas à définir clairement votre rôle par rapport à celui de vos co-auteurs avant de commencer, ou même en cours de route, si vous estimez que des amendements sont nécessaires. Cela a été facile dans mon cas, car mon conseiller et moi-même avons préféré être le principal chercheur et rédacteur et qu'il agisse en tant que consultant sur des questions de haut niveau. Cependant, je suis très conscient que d’autres cas n’ont pas fonctionné de façon aussi harmonieuse.
  8. 8. Lisez attentivement les instructions du journal concernant les soumissions.. Vous devriez avoir l'adresse email d'un éditeur au journal; n'hésitez pas à poser des questions. Ne pas ignorer les limites de page du journal ou les exigences de formatage. Portez une attention particulière aux exigences graphiques pour les figures. Assurez-vous d’obtenir l’autorisation de reproduire les chiffres de votre examen. (Cela se fait généralement en suivant les instructions de permission sur le site Web de la revue dans laquelle figure le chiffre original. C’est également une bonne idée d’envoyer un courrier électronique aux auteurs des chiffres pour les avertir que vous utiliserez leur travail).
  9. 9. Familiarisez-vous avec les logiciels comme Papiers (ou tout autre logiciel de gestion de PDF), EndNote et Adobe Illustrator (ou tout programme graphique suggéré par le journal). Pour moi, les didacticiels en ligne Adobe Illustrator offraient de belles pauses lorsque je lisais depuis des heures et des heures.
  10. 10. Vos collègues de laboratoire et vos collaborateurs peuvent également vous aider dans le processus de modification.. Plutôt que de demander à une ou deux personnes de vous aider à éditer l'article en entier, divisez-le en plusieurs sections et demandez à un collègue différent de l'aider à réviser une section sur un sujet avec lequel vous savez qu'il est familier. Une autre stratégie consiste à donner tout ou partie de votre article à un étudiant diplômé de première année ou à un scientifique dans un domaine légèrement différent. Il ou elle est votre public cible et vous indiquera s'il y a des sections à réviser pour plus de clarté.

feature_review_crawfordEmily Crawford (emily.crawford@ucsf.edu) est un étudiant diplômé de l’Université de Californie à San Francisco.

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